مسلما هر کاری که انجام می شود مشکلات و معایبی دارد؛ همچنین خطر هایی آن را تهدید می کند.
در زمینه طراحی سایت برای تجارت الکترونیک ، خطر های زیادی باید در نظر گرفته شود که مهمترین مسئله در بستر جهانی اینترنت که همگان به آن دسترسی دارند، مسئله امنیت تبادل اطلاعات می باشد.
چند نمونه از چالش ها و خطر های موجود که باید در طراحی سایت برای کسب و کار الکترونیک و تجارت الکترونیک با آنها آشنا باشیم، این موارد می باشند:
- قانون گذاری در موارد به وجود آمدن تخلفات الکترونیکی
- حریم خصوصی در دنیای مجازی و شبکه جهانی اینترنت
- امنیت معاملات
- امنیت مبادلات
- تعرفه های خدمات الکترونیکی
- قانون مالیاتی بر روی معاملات الکترونیکی
- حفظ مالکیت مادی و معنوی در دنیای مجازی
طراحان سایت باید این تهدید ها را برای وب سایتی که طراحی می نمایند، در نظر بگیرند. زیرا طراحی سایت آنها بدون در نظر گرفتن این موارد می تواند به راحتی هک شود و از دست برود.